I det 21. århundrede er det funklende Neo-Tokyo rejst sig fra ruinerne af et Tokyo, der blev ødelagt af en apokalyptisk telekinetisk eksplosion fra en ung dreng ved navn Akira – emnet for et hemmeligt regeringsforsøg, der gik galt, og som nu har været fængslet i frossen stase i tre årtier. Men Tetsuo, en ustabil ung mand med enorme paranormale evner, har gjort det utænkelige: Han har frigivet Akira og sat gang i en kæde af begivenheder, der endnu en gang kan ødelægge byen og trække verden til randen af Harmageddon.