Cocoon... En utopi hængende i himmelrummet. Dens indbyggere har altid levet i den fred og velstand, som Sanctum har indført. For dem er denne verden et sandt paradis. Under beskyttelse af deres beskyttere, fal'Cie, lever folket i Cocoon således lykkelige dage, der synes aldrig at skulle ende... Men alt ændrer sig den dag, en fjendtlig fal'Cie vågner. Kommet fra Pulse, den afskyede og frygtede Underværden...