8. århundrede, i Nordamerika. I erobringskrigens kaos og vold gennemgår Shay Patrick Cormac, en brændende ung rekrut til Assassin Brotherhood, en ond transformation, der for altid vil ændre koloniernes fremtid. Efter en mission med et dramatisk udfald. Shay vender ryggen til Assassins og bliver manden, der skal nedkæmpe. Afvist af dem, han engang betragtede som sine...