En CIA-officer og hans rekrut ankommer til Damaskus for at jage en morder. CIA-sagsbehandler Sam Joseph sendes til Paris for at rekruttere den syriske paladsmedarbejder Mariam Haddad. De to ender i et forbudt forhold, hvilket forstærker Haddads rekruttering og skaber ubeskrivelig fare, da de kommer ind i Damaskus for at finde manden, der er ansvarlig for en amerikansk spions forsvinden. Men jagten på morderen fører snart til en række højprofilerede snigmord og opdagelsen af en mørk hemmelighed i hjertet af det syriske regime, hvilket bringer parret under de altseende øjne af Assads spioncatcher, Ali Hassan, og hans bror Rustum, lederen af den frygtede Republikanske Garde.

Med en baggrund af et Syrien, der pulserer af frygt og oprør, er Damascus Station en gribende thriller, der tilbyder en struktureret skildring af spionage, kærlighed, loyalitet og forræderi i en af de vanskeligste CIA-opgaver på planeten.