Fra toppen af Megacity S1-9 regerer den suveræne Khan med jern- og kødnæver. Under byens rådnende fundament begiver en hævngerrig kriger sig ud på en rejse for at myrde ham. 5 år før begivenhederne i Slave Zero, bringer Slave Zero X nyt liv til en verden, hvor forfærdelige, levende maskiner kendt som Slaves er klar til at blive de nyeste krigsværktøjer i menneskehedens lange og blodige historie. En hemmelig gruppe krigere kendt som The Guardians håber at stoppe disse biomeka fra at blive sluppet løs på verden, men en sværdkæmper blandt deres rækker har en anden idé: brug fjendens eget våben mod dem. Ved at fusionere med en stjålen Slave Unit Prototype, vil Shou blive en rasende Djævel i jagten på at dræbe en falsk Gud.