En storslået rejse gennem Pokémon-historien! Hundredvis af år før Pokémon Brilliant Diamond og Pokémon Shining Pearl-eventyrene er du fordybet i den stort set uudforskede Hisui-region (i dag kendt som Sinnoh)! En verden fuld af muligheder åbner sig foran dig, og du er betroet en mission: at bygge den allerførste Pokédex i denne region. Når du gennemfører dine udforskningsmissioner, skal du holde øje med Pokémon i deres omgivelser og kaste Poké Ballens forfader for at forsøge at fange dem i realtid.