Et lig skylles ned ad floden, svøbet ind i plast, i den lille by Deer Meadow, Washington. FBI involveres, men midt i efterforskningen forsvinder den ene agent sporløst. Han erstattes af den intuitive specialagent Dale Cooper, som har på fornemmelsen, at morderen vil gentage sin forbrydelse. Et år senere, i Twin Peaks, lever Laura Palmer et selvdestruktivt liv som en følge af sine barndomstraumer. Så dukker morderen op i gen. Twin Peaks: Fire Walk with Me er langfilmen, som knytter de løse ender fra kultserien sammen ved at fortælle om hændelserne, som gik forud for serien.