Noget mystisk efterlader sig et spor af ødelæggelse i gaderne i 1926 New York og truer med at afsløre troldmandsverdenen. Newt Scamander ankommer til byen nær slutningen af sin jordomrejse for at undersøge og redde magiske væsner. Da den intetanende No-Maj Jacob Kowalski ved et uheld slipper nogle af Newts dyr løs, må en gruppe usandsynlige helte genfinde de forsvundne dyr, før de kommer til skade – men deres mission støder på mørke kræfter.