Den 13-årige dreng, Svip, er vild med spænding, hvilket han en dag, på en fisketur, får mere end rigeligt af. Sammen med sin jævnaldrende, lidt nørdede fætter, Poul, og sin lillesøster, Stella, bliver Svip forvandlet til en fisk og får en helt ny verden at se. I et kapløb med tiden for at blive mennesker igen, får de tre børn et eventyr, der indbærer møder med alt fra videnskabsmanden Professor Mac Krell til den magtsyge Krabbe.

Instruktøren Stefan Fjeldmark og medinstruktøren Michael Hegner var begge med på produktionen Jungledyret Hugo fra 1993, og med Hjælp Jeg Er En Fisk er armbevægelser mindst lige så store. Eksempelvis er der i knap halvdelen af filmens scener benyttet 3D-animationsteknik, der giver figurerne en meget levende fremtræden, og også deltaljen er der kælet for: hensigten har været, at hvert enkelt billede i filmen skal være et kunstværk i sig selv.