Da en række uforklarlige hændelser begynder at forurolige det videnskabelige samfund over hele kloden, opdager havbiologiprofessor Sigur Johanson en ukendt gletsjerorm i Norge, der truer med at destabilisere kontinentalskråningerne i havene og udløse tsunamier. I mellemtiden konfronteres molekylærbiolog Cécile Roche i Frankrig med en dødelig patogen, der forurener vandet. Samtidig forsøger Leon Anawak, en ung canadisk zoolog og ekspert i hvaler, at forklare den usædvanlige og farlige adfærd hos nogle hvaler, der er begyndt at angribe skibe brutalt. Overbevist om, at en ny intelligent havorganisme kan manipulere miljøet for at sikre sin overlevelse mod mennesker, slutter de sig til en gruppe eksperter på en risikabel mission til havets iskolde dybder. Ingen tror på dem, men den menneskelige race kan være på randen af udryddelse uden at vide det. De skal overbevise verden om, hvad der er i vente, før det er for sent.